WCS sistema yra atsakinga už planavimą tarp sistemos ir įrangos ir siunčia WMS sistemos siunčiamas komandas kiekvienai įrangai koordinuotam darbui. Tarp įrangos ir WCS sistemos palaikomas nuolatinis ryšys. Kai įranga atlieka užduotį, WCS sistema automatiškai atlieka duomenų paskelbimą su WMS sistema.